Lịch sử của Trường THCS THPT Phú Thạnh là quá trình hình thành và phát triển liên tục đầy khó khăn và thử thách trong suốt hơn 14 năm. Từ những ngày đầu mới thành lập đến nay đã trải qua các giai đoạn. Sau ngày Miền Nam hoàn toàn giải phóng trên mãnh đất cù lao Lợi Quan ngày ấy quanh năm nước mặn, phần chua, đồng khô, cỏ cháy nơi nuôi dưỡng mơ ước con chữ của biết bao thế hệ học trò đi trước.

Mãi đến năm 1978, Phòng Giáo dục Huyện Gò Công Tây thông qua quyết định thành lập Trường tiểu học Phú Thạnh do thầy Nguyễn Ngọc Phát làm Hiệu trưởng những nỗ lực phấn đấu vươn lên vì cái tâm của nghề giáo dục “Dù có khó khăn đến đấu vẫn phải thi đua dạy tốt học tốt”. Tuy nhiên, do điều kiện cơ sở vật chất và đội ngũ giáo viên còn hạn chế nên khi thành lập, trường Tiểu học Phú Thạnh đã trải qua nhiều thế hệ lãnh đạo. Đến năm 1982, thầy Phan Văn Sáng về nhận nhiệm vụ Hiệu trưởng nhà trường.

Sau đó, năm 1984 thầy Ngô Đề Mới đảm nhiệm chức danh Hiệu trưởng nhà trường. Chỉ khoảng hơn một năm, đến năm 1985, thầy Nguyễn Thành Thông nhận nhiệm vụ vai trò Hiệu trưởng quản lí nhà trường. Ba năm sau đến năm 1988 thì Thầy Nguyễn Văn Tâm giữ chức vụ Hiệu trưởng. Và mãi đến năm 1991 thì thầy Phạm Trung Hiếu nhận nhiệm vụ quản lí nhà trường với chức danh Hiệu trưởng.

Nhưng đến năm học 1999-2000, lần đầu tiên trường được Phòng giáo dục huyện Gò Công Tây cho phép được tuyển sinh 2 lớp 6 đó là một bước chuyển mình mới trong công tác giáo dục của trường Tiểu học Phú Thạnh. Sau đó lại đổi tên thành Trường Tiểu học và Trung học cơ sở Phú Thạnh do thầy Phạm Trung Hiếu đảm nhiệm chức danh Hiệu trưởng. Trải qua giai đoạn khó khăn vất vả của ngành giáo dục huyện nhà. Tuy nhiên sự khó khăn vất vả không làm nản chí đội ngũ giáo viên và các em học sinh. Chính vì vậy đến năm 2005, phòng giáo dục và đào tạo huyện Gò Công Tây thông qua quyết định thành lập trường Trung học cơ sở Phú Thạnh trên cơ sở trường Tiểu học Phú Thạnh và Trung học cơ sở Phú Thạnh. Đảm nhiệm chức danh Hiệu trường của trường là thầy Ngô Văn Bi. Từ đó ngành giáo dục tại mảnh đất Cù lao Lợi Quan từng bước phát triển.

Đến năm 2007, Sở giáo dục và đào tạo tỉnh Tiền Giang thông qua quyết định thành lập Trường THCS và THPT Phú Thạnh do thầy Nguyễn Văn Đương giữ chức danh Hiệu trưởng. Khi mới thành lập trường, về điều kiện cơ sở vật chất đội ngũ giáo viên còn rất nhiều hạn chế. Nhưng với quyết tâm vì cái tâm, cái tình với nghề, các thầy cô vẫn bám lấy trường và từng ngày gieo từng cái chữ, từng con số, từng vần thơ đến với các em học sinh. Dù khó khăn, nhưng các thầy các cô mong muốn các em nhận thấy được rằng học là nhiệm vụ là sứ mệnh của các em, vì Bác Hồ có nói: “Non sông Việt Nam có trở nên tươi đẹp hay không, dân tộc Việt Nam có bước tới đài vinh quang để sánh vai với các cường quốc năm châu được hay không, chính là nhờ một phần lớn ở công học tập của các em”.

Hơn 14 năm hình thành và phát triển, Trường THCS và THPT Phú Thạnh cũng với những nỗ lực của tập thể giáo viên nhà trường đã ngày càng chứng tỏ được vị thế của mình trên bản đồ giáo dục của tỉnh Tiền Giang. So với các trường trên địa bàn tỉnh thì Trường THCS và THPT Phú Thạnh còn rất trẻ. Nhưng với những nỗ lực cố gắng thì thành tích của thầy và trò Trường THCS và THPT Phú Thạnh đã đạt được được các cấp, các ngành và địa phương ghi nhận và tặng thưởng nhiều danh hiệu cao quí: Nhà trường được ủy ban nhân dân tỉnh Tiền Giang trao tặng bằng khen và Sở giáo dục đào tạo Tỉnh Tiền Giang trao tặng danh hiệu tập thể lao động xuất sắc nhiều năm liền và nhiều giấy khen của các cấp các ngành địa phương; về cá nhân: giáo viên của trường hàng năm đều có rất nhiều sáng kiến kinh nghiệm dự thi và đạt kết quả cao và đó cũng là một thương hiệu gắn liền với đơn vị THCS và THPT Phú Thạnh, về học sinh: trường nhiều năm liền có học sinh khối 12 dự thi tốt nghiệp THPT đạt tỉ lệ đậu 100%, thành tích thể dục thể thao trong các kỳ Hội khỏe Phù Đổng cấp tỉnh nhiều năm đứng trong tốp 10 toàn tỉnh, hàng năm trường có rất nhiều học sinh tham gia các kỳ thi học sinh giỏi văn hóa, máy tính cầm tay, sáng tạo trẻ và đạt được nhiều thành tích cao.

Những thành tích trên của nhà trường là rất vẻ vang, nó được xây lên từ truyền thống giáo dục của ông cha ta qua bao thế hệ như đạo lí của nhà giáo Võ Trường Toản “Lương sư, hưng quốc”, quốc gia có những người thầy giỏi và có một nền giáo dục tốt, thì sẽ hưng thịnh. Ngoài ra, nó còn được kết tinh bởi truyền thống “đoàn kết – kỷ cương – tình thương – trách nhiệm” của tập thể hội đồng sư phạm trường THCS và THPT Phú Thạnh. Tiếp tục kế thừa và phát huy hơn nữa truyền thống đạt được hơn 14 năm qua, đó là nhiệm vụ mục tiêu phấn đấu phát triển hơn nữa trong thời gian sắp tới của trường THCS và THPT Phú Thạnh, nhằm đào tạo chất lượng nguồn nhân lực cao và bồi dưỡng nhân tài cho đất nước dựa trên mục tiêu phát triển của nền giáo dục nước nhà theo định hướng công nghiệp hóa – hiện đại hóa đất nước